Amennyiben rosszul választjuk meg a szigetelőanyagot, hamarosan szembe kell néznünk a penészesedés problémájával. A legelső és legfontosabb lépés a vályogház vízszigetelésének biztosítása hőszigetelés előtt. A hőszigetelés csak eztán következhet. Egyes szakemberek szerint a polisztirol szigetelőanyagok nem alkalmasak a vályogfalak szigetelésére, mivel elzárják a levegő útját, a fal nem tud szellőzni így képtelen leadni a felgyülemlett párát. Ennek eredménye a fal vizesedése és dohosodása lesz, hosszabb távon pedig az épület szerkezete is károsodhat. Mások azon a véleményen vannak, hogy amennyiben a vízszigetelés teljesen megoldott, EPS polisztirollal lehet vályogfalakat is szigetelni. Az üveggyapot vagy a kőzetgyapot biztosan megfelelő szigetelőanyagok a vályogfalak szigeteléséhez. Szakemberek állítása szerint a vályogfalak biztonságosan szigetelhetőek üveg- vagy kőzetgyapottal. A padló szigetelését is érdemes valamilyen természetes anyaggal megoldani, mint például a kerámiaburkolat vagy a kavicsréteg.
Próbáljuk meg elkerülni, hogy épületünk félig legyen alápincézve: ha pincét építünk, az legyen a teljes épület alatt! Természetesen félig alápincézett épületet is lehet készíteni, de itt a szigetelési csomópontok/átvezetések igen bonyolultak, könnyen elronthatók a kivitelezés alatt, és a tapasztalatok szerint túlnyomó részben el is rontják. A vízszigetelést bízzuk szakemberre! A munkálatok megkezdése előtt nézzük meg a talajmechanikai (geo technikai) szakvéleményt, ahol leírják, hogy adott helyen milyenek a talajvízviszonyok, mire számíthatunk. Az állandó talajvíznyomás elleni szigetelést három rétegbe készítsük: az egyik réteg mindenképpen PV erősítésű legyen, a bitumentartalom legalább 4 kg/m 2. Időszakos talajvíznyomás esetén célszerű szivárgót építeni, gondoskodjunk a szivárgó víz elvezetéséről. Nagyon fontos a szigetelés megfelelő fogadófelületének kialakítása, az legyen lesimított, pormentes és száraz aljzat/felület. Figyeljünk a beépítendő szigetelőanyagok helyes megválasztására: elengedhetetlen a vízszigetelő anyagok jó minősége, nagy nyomó és szakítószilárdsága, legalább 4 mm-es vastagsága.